HPV ваксината е рекомбинантна. Това означава, че тя съдържа частици, подобни на тези във вируса, които са получени чрез рекомбинантна технология. Ваксината не съдържа самия вирус, a само копия на протеини, открити във вируса, които му помагат да промени поведението на клетките. Тези частици са отговорни за стимулиране на имунната система на организма.